ओवैसी ने एनडीए सरकार पर रोहिंग्याआ मुसलमानों को लेकर निशाना साधा हैं। ऑल इंडिया मजलिस-ए-इतेहादुल मुसलिमीन (एआईएमआईएम) के अध्यक्ष असदुद्दीन ओवैसी ने कहा कि यदि तिब्बत, बांग्लादेश और श्रीलंका के शरणार्थी भारत में रह सकते है, तो म्यांमार के रोहिंग्या मुस्लिम क्यों नहीं रह सकते। म्यांमार के हिंसाग्रस्त रखाइन प्रांत से भागे रोहिंग्या पर रूख को लेकर एनडीए सरकार पर निशाना साधते हुए उन्होंने कहा ‘‘ अपना सब कुछ खो चुके उन लोगों को क्या वापस भेजना मानवता है। यह गलत है।’ उन्होंने हैदराबाद में गुरुवार की देर रात लोगों को संबोधित करते हुए पूछा,‘‘ यदि बांग्लादेशी लेखिका तसलीमा नसरीन भारत में शरण ले सकती है तो रोहिंग्या मुसलमान क्यो नहीं।’’
हैदराबाद से लोकसभा सदस्य ओवैसी ने कहा ‘‘जब तसलीमा नसरीन आपकी बहन हो सकती हैं तो रोहिंग्या भी आपके भाई हो सकते है, मिस्टर मोदी।’’ उन्होंने कहा कि केन्द्र की बीजेपी सरकार को रोहिंग्या को शरणार्थी के रूप में देखना चाहिए न कि मुसलमान के रूप में।’’ ओवैसी ने कहा ‘‘ भारत ने तिब्बत, श्रीलंका और बंगलादेश के चकमा शरणार्थियों को शरण दी।’’
ओवैसी ने कहा ‘‘जब यह बताया गया कि वे (श्रीलंकाई शरणार्थी) आतंक में हिस्सा ले रहे है , क्या किया गया था? उन्हें एक शिविर से दूसरे शिविर में स्थानांतरित कर दिया गया।’’ उन्होंने कहा कि भारत का संविधान सभी को समानता का अधिकार देता है और यह शरणार्थियों पर भी लागू होता है। ओवैसी ने कहा ‘‘बीजेपी सरकार कहती है कि हम राहिंग्या मुस्लिमों को वापस भेजेंगे। हम भारतीय प्रधानमंत्री से यह पूछना चाहते है कि किस कानून के तहत आप उन्हें वापस भेजेंगे।’’