जब 2009 में चैंपियन ट्राफी को स्थगित कर दिया गया था तब उनको इंडियन क्रिकेट टीम में श्रीलंका में एकदिवसीय सीरीज के टूर के लिए चुन लिया गया। इस टूर की शूरवात में उनको Indian A Team की तरफ से खेलने का अवसर मिला था। इसके बाद जब ओपनिंग बैट्समैन में सहवाग और तेंदुलकर दोनों घायल हो गये थे तब विराट को उनकी जगह पर पहली बार भारतीय टीम में खेलने का अवसर मिला। इस टूर में उन्होंने अपना पहला एकदिवसीय अर्द्धशतक मारा था और इस सीरीज में भारत की जीत हुयी थी। इसके बाद उनक कई बार इंडियन टीम में चयन हुआ था लेकिन दिग्गज खिलाडियों की वजह से उन्हें खेलने का अवसर नही मिला था।
जुलाई-अगस्त 2009 में विराट को ऑस्ट्रेलिया के खिलाफ Emerging Players Tournament के लिए चयन किया गया था | इस सीरीज में वो 398 रन बनाकर टॉप स्कोरर रहे थे। इस सीरीज के अंतिम मैच में साउथ अफ्रीका के खिलाफ शतक की बदौलत वो मैच जीती थी और उन्हें मैन ऑफ़ मैच का अवार्ड मिला था। ये सीरीज उनके जीवन में एक महत्वपूर्ण मोड़ लेकर आयी।2009 में ICC Champions Trophy में जब युवराज सिंह घायल हो गये थे तब substitute के तौर पर उन्होंने मैच खेला था। इसके बाद कई बार भारत में और विदेशी जमीन पर कई बार उन्होंने substitute के तौर पर खेला था।
